Położony na rogu ulic Szpitalnej i św. Tomasza. Wzniesiony w latach 1618-21 na miejscu zburzonego w 1591 r. zboru ariańskiego; barokowy, salowy, nakryty kolebkowym sklepieniem na gurtach. We wnętrzu zachowały się barokowe ołtarze i ambona z około 1700 r., wykonana przez Jerzego Hankisa. W ołtarzu głównym obraz Matki Boskiej Większej z początku XVII w. W przedsionku zwraca uwagę barokowa rzeźba Chrystus Bolesny (2 połowa XVIII w.), pochodząca z kościoła św. Ducha, zburzonego w 1892 r. Do kościoła przylega klasztor wzniesiony w 1 połowie XVII w. Do 1787 r. kościół i klasztor znajdowały się w posiadaniu karmelitów trzewiczkowych, od 1800 r. duchaczek, które prowadziły tutaj szkołę (do 1948 r.).