ul. Szeroka 24
Najcenniejsze zabytki muzealnej kolekcji judaików eksponowane są na stałej wystawie "Z Dziejów i Kultury Żydów w Krakowie". W dawnych modlitewniach męskiej i kobiecej na parterze Starej Bożnicy wystawione są przedmioty żydowskiej sztuki obrzędowej, zaprezentowane w trzech głównych grupach tematycznych: synagoga, święta i obrzędy doroczne, życie prywatne i rodzinne. W dwóch salach na pierwszym piętrze muzeum znajduje się dalsza część ekspozycji, prezentująca malarstwo portretowe i ikonografię dzielnicy żydowskiej na Kazimierzu oraz dokumentująca zagładę Żydów krakowskich w latach II wojny światowej.
pl. Bohaterów Getta 18
Apteka pod Orłem zajmuje pomieszczenia dawnej apteki mgr Tadeusza Pankiewicza, która w latach okupacji niemieckiej znajdowała się w centrum krakowskiego getta. Jest to miejsce, gdzie w szczególny sposób wiązały się losy Polaków i Żydów. Mgr Tadeusz Pankiewicz - jedyny Polak zamieszkały w getcie wraz z polskim personelem nieśli stałą pomoc mieszkańcom getta. Apteka, pełniąca całodobowy dyżur, była miejscem kontaktów, spotkań, informacji. Każdy kto zwrócił się tu o pomoc był pewien, że ją otrzyma.
ul. Lipowa 4
Stała pt. Kraków - czas okupacji (1939-1945) poświęcona jest dziejom Krakowa i jego mieszkańców w latach wojny. Ekspozycja podzielona jest na kilkanaście segmentów tematycznych: wojna 1939 r., rola Krakowa, jako ośrodka władzy Generalnego Gubernatorstwa, życie codzienne i rodzinne, los Żydów krakowskich, opór i tajne państwo, czy wreszcie dzieje fabryki, ludzi w niej pracujących i jej właściciela Oskara Schindlera. Ważnym łącznikiem segmentów wystawy jest symboliczna ulica krakowska, na której spotykali się Polacy, Żydzi i Niemcy.
Uwaga! Aby odwiedzić Muzeum należy wcześniej dokonać internetowej rezerwacji wejściówek na stronie www.bilety.mhk.pl
ul. św. Wawrzyńca 15
Muzeum Inżynierii Miejskiej gromadzi obiekty ilustrujące rozwój techniki, przemysłu i inżynierii miejskiej. Zbiory muzeum obejmują także reprezentatywną kolekcję samochodów i motocykli polskiej produkcji. Muzeum prowadzi także działalność na rzecz edukacji dzieci i młodzieży w zakresie historii nauki, techniki i przemysłu. Ekspozycje Muzeum są prezentowane we wnętrzach hal dawnej zajezdni tramwajowej na krakowskim Kazimierzu: w hali tramwaju konnego z 1882 r., hali wąskotorowego tramwaju elektrycznego, datowanej na rok 1900 oraz hali tramwaju elektrycznego normalnotorowego z 1913 roku.
ul. Limanowskiego 13
W salach Domu Historii Podgórza można oglądać ekspozycję stałą, na którą składają się eksponaty podarowane placówce przez instytucje oraz mieszkańców Podgórza. Działalność Domu Historii Podgórza obejmuje również wykłady i prelekcje na temat historii Podgórza. Mają tu również miejsce wystawy czasowe – nawiązujące tematyką do historii i czasów współczesnych Podgórza – fotografii, pocztówek, projektów architektonicznych budynków i innych form plastycznych.